一、结构

    人Apo CII为含79个氨基酸残基的单链多肽, 分子量为9.1kD。先合成的Apo CII含101氨基酸残,其中 22个氨基酸构成信号肽, 除去信号肽后则转变为成熟Apo CII。Apo CII的等电点为5.0, 其氨基酸组成有3个特点: (1)缺乏组氨酸和半胱氨酸; (2) 含有较多的极性氨基酸; (3)苏氨酸及丝氨酸较高。

    对Apo CII的氨基酸序列进行Chuo-Fasman分析表明: Apo CII的第13-22, 29-40,43-52氨基酸残基为双性α螺旋, 具有与脂质结合的功能, 第9-12、23- 26 、53-56氨基酸残基为β转角结构, 第61-74AA残基为α-双性螺旋, 是与脂质 结合的区域, 第1-39、54-69氨基酸残基为β-转角结构。对Apo CII溴化氰水解片段或合成片段的研究表明: Apo CII激活LPL的肽段为羧基端56-79氨基酸残基, 其激活作用可被具有结合磷脂活性的第44-55氨基酸残基段加强; 切除Apo CII羧基末端3 个氨基酸残基, Apo CII激活LPL的活性完全丧失。

    Apo CII基因与Apo CI、Apo E基因成簇排列, 位于19 号染色体长臂 q13 区。Apo CII基因长3320bp, 含4个外显子和3个内含子。外显子分别为29bp 、 68bp 、160bp和241bp。外显子1包括mRNA 5'端非翻译区的大部分, 外显子2包含5' 端非翻译区的小部分(约13bp)及信号肽中前18 个氨基酸的密码子, 外显子3由编码信号肽后9个氨基酸及成熟Apo CII蛋白的1050位氨基酸的核苷酸组成。外显子4 包括编码成熟Apo CII蛋白的51-79位氨基酸的核苷酸顺序及3'端非编码区。在3'非编码区有3个poly A信号, 在此apoly A后还有一个Alu复序列存在, 其意义尚不清楚。 内含子分别为2386bp、1676和296bp。内含子1位于蛋氨酸起始密码(翻译起始点)上游第13与14核苷酸之间, 把外显子1和外显子2隔开。内含子2在编码信号肽的第4位氨基酸的密码子处把外显子2和外显子3隔开。内含子3则在编码第50 氨基酸密码子处将外显子3和外显子4隔开。内含子1含有4个Alu重复序列且富含GC。内含子3含有 36- 40bp 的重复序列 , 在这些重复序上游 31bp处有一个潜在的增强核心序列: CATACCAC。在转录起始点上游6个bp组成TATA盒,可能为启动子的一部分。