该书最早描述胆道蛔虫病及其治法，其中乌梅汤是驱除胆道蛔虫的世界最早有效方剂。近年来，通过中西医结合治疗急性传染病，证明《伤寒论》中的茵陈蒿汤对急性黄疸型肝炎；麻杏石甘汤对急性支气管炎、肺炎；白虎汤对乙型脑炎，确有显著疗效。又如中西医结合治疗急腹症，证明乌梅丸治疗胆道蛔虫；复方大承气汤治疗肠梗阻；大黄牡丹皮汤，薏苡附子败酱散治疗急性阑尾炎等等，均有确实效果。

《伤寒论》不仅指导着我国医学家的临床治疗，而且还流传到日本、朝鲜等许多国家。特别是在日本，它被长期作为指导临床的专书。